Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rbbp8nlA2ABX0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rbbp8nlA2ABX0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms