Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm884A2A9H6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm884A2A9H6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms