Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Chd5A2A8L1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chd5A2A8L1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chd5A2A8L1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms