Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam71e1A1L3C1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam71e1A1L3C1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms