Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms