Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4921501E09RikA0A0R4J054 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4921501E09RikA0A0R4J054 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms