Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc166S4R181 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc166S4R181 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms