Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Hdac5Q9Z2V6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Hdac5Q9Z2V6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hdac5Q9Z2V6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms