Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vamp5Q9Z2P8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms