Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Robo3Q9Z2I4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Robo3Q9Z2I4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms