Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tulp1Q9Z273 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tulp1Q9Z273 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tulp1Q9Z273 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms