Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trip6Q9Z1Y4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trip6Q9Z1Y4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trip6Q9Z1Y4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms