Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms