Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sumo3Q9Z172 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms