Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl8Q9Z121 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl8Q9Z121 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms