Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmg20bQ9Z104 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmg20bQ9Z104 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms