Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapaQ9WV55 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VapaQ9WV55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms