Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr4Q9WUF2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr4Q9WUF2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms