Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul1Q9WTX6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cul1Q9WTX6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms