Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spo11Q9WTK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Spo11Q9WTK8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms