Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Taf7Q9R1C0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf7Q9R1C0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf7Q9R1C0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms