Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc26a4Q9R155 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc26a4Q9R155 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc26a4Q9R155 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms