Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtsjQ9R014 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtsjQ9R014 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms