Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps29Q9QZ88 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps29Q9QZ88 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms