Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Pkp3Q9QY23 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pkp3Q9QY23 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pkp3Q9QY23 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms