Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nr2e3Q9QXZ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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