Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Apbb1Q9QXJ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Apbb1Q9QXJ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms