Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tinf2Q9QXG9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tinf2Q9QXG9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms