Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tcea2Q9QVN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tcea2Q9QVN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms