Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dkk3Q9QUN9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dkk3Q9QUN9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms