Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cdkl2Q9QUK0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms