Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Csnk1eQ9JMK2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms