Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmub1Q9JMG3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmub1Q9JMG3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms