Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfmbt1Q9JMD1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sfmbt1Q9JMD1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms