Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd2apQ9JLQ0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd2apQ9JLQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd2apQ9JLQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms