Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp1Q9JLK7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cabp1Q9JLK7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cabp1Q9JLK7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms