Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CubnQ9JLB4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CubnQ9JLB4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CubnQ9JLB4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
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