Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AtrQ9JKK8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AtrQ9JKK8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms