Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp39a1Q9JKJ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms