Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl39Q9JKF7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl39Q9JKF7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms