Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gpa33Q9JKA5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpa33Q9JKA5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms