Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cnga3Q9JJZ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnga3Q9JJZ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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