Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Alyref2Q9JJW6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Alyref2Q9JJW6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms