Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Akip1Q9JJR5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Akip1Q9JJR5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms