Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PigbQ9JJQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PigbQ9JJQ0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PigbQ9JJQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms