Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Efcc1Q9JJF6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efcc1Q9JJF6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efcc1Q9JJF6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms