Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Riox1Q9JJF3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Riox1Q9JJF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms