Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lmbr1Q9JIT0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lmbr1Q9JIT0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lmbr1Q9JIT0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms