Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Praf2Q9JIG8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Praf2Q9JIG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms