Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ppp1r3fQ9JIG4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppp1r3fQ9JIG4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms